生物配列解析基礎

生物配列解析基礎（第１回）

DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
http://www.ddbj.nig.ac.jp/

National Center for Biotechnology Information (NCBI)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/

Integbioデータベースカタログ
http://integbio.jp/dbcatalog/?lang=ja

BLAST
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi

BLAST(GenomeNet)
http://www.genome.jp/tools/blast/

>sample1
MNRVFLFGKLSFTPNRLQTKNGTLGATFSMECLDSSGFNNAKSFIRVTAWGKVASFIVAQ
NPGVMLFVEGRLTTYKITNSENKNTYALQVTADKIFHPDEKTTNEEPIKSTVVDSPFMNP
KASVTEAEFEQAFPHQDETDFNNITPIFENDVQLEEESDD

>sample2
AATTAGAGAAAACAACAGAGTTGTTATTTCTAGTGATGTTCTTGTTAACAACTAAACGAA
CAATGTTTGTTTTTCTTGTTTTATTGCCACTAGTCTCTAGTCAGTGTGTTAATCTTACAA
CCAGAACTCAATTACCCCCTGCATACACTAATTCTTTCACACGTGGTGTTTATTACCCTG
ACAAAGTTTTCAGATCCTCAGTTTTACATTCAACTCAGGACTTGTTCTTACCTTTCTTTT
CCAATGTTACTTGGTTCCATGCTATACATGTCTCTGGGACCAATGGTACTAAGAGGTTTG
ATAACCCTGTCCTACCATTTAATGATGGTGTTTATTTTGCTTCCACTGAGAAGTCTAACA
TAATAAGAGGCTGGATTTTTGGTACTACTTTAGATTCGAAGACCCAGTCCCTACTTATTG
TTAATAACGCTACTAATGTTGTTATTAAAGTCTGTGAATTTCAATTTTGTAATGATCCAT
TTTTGGGTGTTTATTACCACAAAAACAACAAAAGTTGGATGGAAAGTGAGTTCAGAGTTT
ATTCTAGTGCGAATAATTGCACTTTTGAATATGTCTCTCAGCCTTTTCTTATGGACCTTG
AAGGAAAACAGGGTAATTTCAAAAATCTTAGGGAATTTGTGTTTAAGAATATTGATGGTT
ATTTTAAAATATATTCTAAGCACACGCCTATTAATTTAGTGCGTGATCTCCCTCAGGGTT
TTTCGGCTTTAGAACCATTGGTAGATTTGCCAATAGGTATTAACATCACTAGGTTTCAAA
CTTTACTTGCTTTACATAGAAGTTATTTGACTCCTGGTGATTCTTCTTCAGGTTGGACAG
CTGGTGCTGCAGCTTATTATGTGGGTTATCTTCAACCTAGGACTTTTCTATTAAAATATA
ATGAAAATGGAACCA

>sample3
TTGAAGAGGACTTGGAACTTCGAT

>sample4
MSKKINNNKTPRNKVKNNNVSKDNDDIVISLRYENWVKEERVNSLTTYTKDENQFLKNII
YILNTLFPYVYKNWKNKGINDHCHPIKQNNVFSKYIKLIKKLHPNLLKNDNEELELYQLG
LGRSVRVICSKIDNILFPLLIDHHHLGYESQSYNDKDTKKYDYCPLRKYNKNQDN

>sample5
MDENETQFNKLNQVKNKLKIGVFGIGGAGNNIVDASLYHYPNLASENIHFYAINSDLQHL
AFKTNVKNKLLIQDHTNKGFGAGGDPAKGASLAISFQEQFNTLTDGYDFCILVAGFGKGT
GTGATPVFSKILKTKKILNVAIVTYPSLNEGLTVRNKATKGLEILNKATDSYMLFCNEKC
TNGIYQLANTEIVSAIKNLIELITIPLQQNIDFEDVRAFFQTKKTNQDQQLFTVTHPFSF
SFDSKDSIEQFAKQFKNFEKVSYFDHSIVGAKKVLLKANINQKIVKLNFKQIQDIIWTKI
DNYQLEIRLGVDFVTTIPNIQIFILSEHKNPVSLPIDNKSTENNQNKLKLLDELKELGMK
YVKHQNQIY