生物配列解析基礎(第1回)
DNA Data Bank of Japan (DDBJ)
http://www.ddbj.nig.ac.jp/
National Center for Biotechnology Information (NCBI)
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/
Universal Protein Resource (UniProt)
http://www.uniprot.org/
ライフサイエンス統合データベースプロジェクト
http://lifesciencedb.jp/lsdb.cgi?pg=0
Sequence Similarity Searching
http://www.ebi.ac.uk/Tools/sss/
FASTA
http://fasta.genome.jp/
BLAST
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
BLAST(GenomeNet)
http://www.genome.jp/tools/blast/
>sample1
MNRVFLFGKLSFTPNRLQTKNGTLGATFSMECLDSSGFNNAKSFIRVTAWGKVASFIVAQ
NPGVMLFVEGRLTTYKITNSENKNTYALQVTADKIFHPDEKTTNEEPIKSTVVDSPFMNP
KASVTEAEFEQAFPHQDETDFNNITPIFENDVQLEEESDD
>sample2
ATGAAATTAAGAATCTGCGAACTTGTTATTAATAAAACTTTAATTACTAAAACTAAAATA
GAAACTATTTTAGAAACTAAAAAAAAAGCCATTCAAAATTATGCCTATATTTTGCATGAT
AAAGATATTTATCAAAATGATAAAGAGGCTCAATTGAATGGTAAAAAAGTAGGAGATATA
AAAGCTCCTCATTGGCATATATATTTAAGATTTAATTATTCACATGATACAAAAAATATC
GCTCAATGGTTTAATACTGAGGATAATTTTGTTTCCAAAATAAAAGGTAGATTTAGTGAT
GCCTTAATGTATATGATTCATGCTAATAGGTCTGATAAACATCAATATGATGAAAAAGAA
GTAGTTAGTAATTTTGATTGGAAATCAGAAGCTCAACAAGATATTTTTAACAGAAAATAT
AAAATGGATGCTCGCTTAAAAGAAATAATAGATAAAATTGAATCTGGTGAATGGAAAAGA
TATGATTTAATCAATAAAATTAATGGTTATGAAAATAATATTTATTATTCAGCAATAAAA
AAAGCATTTGAACGTAGAATTGATTTTTTAGAGGAAATGGAAAGAAAAATGGAATGTATT
TTTATCACTGGTACGAGTGGTTCAGGGAAATCTACTCTTGCCAAAAAAATAGCCGAAAAT
AAAGGCTATAAAGCTTATATTTCATCTGCTAGTAATGATGTTTTAGATAATTATAAAGGT
CAAGAGTGTATTATTTTAGATGACCTACGTTCTTATTGCCTAGTTTTGTCTGATTTATTA
AAGATGTTAGATAATAATACTGCATCATCAGTTAAGAGTCGTTATAAAAATAAAGTTTTA
GAATGTAAATTAATTATTATTACAACTGTTAAAAGTATTGATGATTTTTTTGATGATATT
TTCAACAAAGATGAAAGTATTACTCAATTAAAACGTCGTTGTAAATTACATATTAGTATT
GATTCAAAATATATTACTTTTAAAGTTTGGAATGATGTTGATAAGAAATATAATAAACCT
TATAAAAAACCTAATACTTTATTAAATGAATTCCAAATAAAAAGATTGAGCGAAAAAGAA
GAAAAAGATTATATAAAATCAATTTCTAATATAGATTTAGATGAAGATTTTTAATCTTTT
TATGTTGAATTATCTAGCTTTTTTGATATAATATAAGTGTATTAACCTGACCACAAATAT
TATTATTAATATTAACATATAAAAAATGTTAAAATAATTAATGACTCTATGTATGCGTTC
GGTCAGGTTCGTATATGTAGGGTCATTTTTGTTATGTAAAGCTCACATTAAAAAAATATA
AAAAAAAATAGCTATATAAATCTCATCTCGGCAAAAGAAACGATTTATATAACTACCATG
AAAGGATGCATTATTCATGCAGATATTCAATTATAACATAAGCGCATTTATTGATAAAAT
AAATGATTACGCTATCTTTATTATAACATTTTTAAAGAATATTTTTAACAACATTATAGC
CATTAGAAATGTTGATTTTAGTTTAGTCAATATACCAAATAGTTTAGGGATAATTTGGCA
TTTTATTTTATCTATTCTTTATATTTTAATTTTCATTACTATTTTAGTTTTTATGAGTTC
TATATTTAGTATCTTTAAGCAAATAATAAAATGGACTATTTATAAGCCCATTAAACTTTT
ATTTTTATTAATATATGGTTTTTTTCTATTATTAAAATATTTATTTACTCCCAAATCAAA
TTCAGAACAACCAGTTGAAACTAATAATTCTAATCTAGATGAATTAAAACAATTAAATAA
AAAAATATCAGATTTAGAATACAAACTTAATTTACAAAAAAAACAAAATATAATTAAGAA
AAGTGGTTTTAGATATGAAAAAAAATAAGTCTAATAAAAAAAAGATTATTTTAATCCTTT
GGGGATTTTTATTTGTAATAGCTGTGATTGTTCTTTTATCAATGTTATTATTATCTTTAC
AATCAAAACAATCCCAACAATCATTTAATCAACCAGTAGAGGCTAAACCTATTCAATCTT
CTGCACAAAAAGAACAAGAAACATATAATGCTATTTTAAAAAAAATAGAATCTGAAGTTA
ATGAATTAACAAATATTAAAGAAATAGTTTATCATCCAGATGGTAAAACTATAAAACATA
TTAAAATATTAGATTCTACAACTAAAAAAGAAATTAAAAGAATTGTTTATTATGATGATG
GTAAAACTATAAATTGGATTAAAGAATTTGATCCTCAAACTAGTTTATTAATAAAAAATA
CTATTCATGATAAACAAGGAAGAATTAAAGACATTGTTAAATATAATTCTTTAAGAGAAT
ATGTTTATGAAGAATATAATCCTCAAACAGGCATAAAAATTGGAGAAATCTATTATAACC
CAGATGGAGCTGTTAAAGAAGTAAAAACTTTTTAATTATGAATAAGAAAAGAAAATTAAT
ATTAAATCTTTGGATTATCTTCATTGTTATCGTTCTTCTAATTCTCTTATTTCTTTTAGG
TTTAAGATTACCTAAATTATTTAAATCAATTAAAGATAAAAATAAAGTTGAAACCCAATC
TCAATATCAAACTCAATATATTTATGATACAAATAAAGTTAATAATATAATTGGATTAAT
TAATGCTTTAAAACATTTAAAGCAATTAAAAGAATCCAAAAACAAACAACAAAACAAAGA
ACAAAAAAAACAAGAAGAAGCCCAATATCAATTTGATTGGAATTCAAATTATGATAACGA
TGATAATAAATTAATTAAAGATATCGCAGTCGTAACTCTTGCCACAGGTGCAGCTGTTAT
TAGTTGTGTAGTTCTAGCTCCTATTTTTGCCTCTGTTGGGCCAATAGCAGCTCCTCTTGC
TTTATTAGCTTAATATAAATAGAAAGGAGAAATCAAATGTTAAATAAAGTTCAATTAATA
GGTAATATCACTCATGACCTAGAACCAACAACTATTAATACTAATGAGGGTGAAATATCT
AAATTAGATTTTAGTATAGCAGTTAATATCAAAGATAAAGTTAATTTTATTCCATGCGTT
ATTTTTAGAAACCAAGCAGACAATATGTTTATGTATCTTCATAAAGGTTCTAAAATATAT
>sample3
TTGAAGAGGACTTGGAACTTCGAT
>sample4
MSKKINNNKTPRNKVKNNNVSKDNDDIVISLRYENWVKEERVNSLTTYTKDENQFLKNII
YILNTLFPYVYKNWKNKGINDHCHPIKQNNVFSKYIKLIKKLHPNLLKNDNEELELYQLG
LGRSVRVICSKIDNILFPLLIDHHHLGYESQSYNDKDTKKYDYCPLRKYNKNQDN
>sample5
MDENETQFNKLNQVKNKLKIGVFGIGGAGNNIVDASLYHYPNLASENIHFYAINSDLQHL
AFKTNVKNKLLIQDHTNKGFGAGGDPAKGASLAISFQEQFNTLTDGYDFCILVAGFGKGT
GTGATPVFSKILKTKKILNVAIVTYPSLNEGLTVRNKATKGLEILNKATDSYMLFCNEKC
TNGIYQLANTEIVSAIKNLIELITIPLQQNIDFEDVRAFFQTKKTNQDQQLFTVTHPFSF
SFDSKDSIEQFAKQFKNFEKVSYFDHSIVGAKKVLLKANINQKIVKLNFKQIQDIIWTKI
DNYQLEIRLGVDFVTTIPNIQIFILSEHKNPVSLPIDNKSTENNQNKLKLLDELKELGMK
YVKHQNQIY