General Information

File: DRR000031sub.fastq
Type: FASTQ
Sequence Length Range: 36 to 36
Total Sequences: 6000
Unique Sequences: 5368

Quality by Position


Grey lines: 10% and 90% quantiles
Orange lines: 25% and 75% quartiles
Blue point: median
Green dash: mean
Purple line: lowess curve

Nucleotide Frequency by Position

Nucleotide Proportion by Position

N Frequency by Position

GC Content by Position

Sequence Length Distribution

Most Frequent Sequences

sequence count proportion of total
1 TTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT 4 0.000666666666666667
2 GAAATACAACGATGGTTTTTCATATCATTGGTCGTG 3 5e-04
3 GCTACTCCTACCTATCTCCCCTTTTATACTAATAAT 3 5e-04
4 ACGCAGGCTTATGCGGAGGAGAATGTTTTCATGTTA 3 5e-04
5 TCTTGGACAACCAGCTATCACCAGGCTCGGTAGGTT 2 0.000333333333333333
6 TTTTTGGTCAGAGCGGTCAAGTTAAGTTGAAATCTC 2 0.000333333333333333
7 TCTGCATAATGAATTAACTAGAAATAACTTTGCAAG 2 0.000333333333333333
8 GGATAACAGCGCAATCCTATTCTAGAGTCCATATCA 2 0.000333333333333333
9 GGTGAAGTCTTAGCATGTACTGCTCGGAGGTTGGGT 2 0.000333333333333333
10 GCCGGAGGAGGAGACCCCATTCTATACCAACACCTA 2 0.000333333333333333
11 TTAAGGCGACAGCGATTTCTAGGATAGTCAGTAGAA 2 0.000333333333333333
12 AAGGAGCCAAAGTATAGAACAAGAGAGCCAAGAAAA 2 0.000333333333333333
13 GATCGGAAGAGCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTAGAT 2 0.000333333333333333
14 GGGAGAGATTTGGTATATGATTGAGATGGGGGCTAG 2 0.000333333333333333
15 TAGATTTACGCCGATGAATATGATAGTGAAATGGAT 2 0.000333333333333333
16 GTAGTAAGTTACAATATGGGAGATTATTCCGAAGCC 2 0.000333333333333333
Report produced by the R package qrqc
(c) Vince Buffalo 2011-2012, License: GPL 2.0