ゲノム情報解析基礎バイオインフォマティクス基礎知識(2017年04月17日)門田幸二
バイオインフォマティクス系学会など
バイオインフォマティクス人材育成カリキュラム(次世代シークエンサ)
- バイオサイエンスデータベースセンター(NBDC)運営委員会人材育成分科会で、2014年3月に策定されたNGS用カリキュラムが存在。
このカリキュラムをベースにして、平成26年度よりNBDCと東大アグリバイオ主催でハンズオン(ノートPCを用いた実習型)講義を実施。おそらくアグリバイオ本体に次ぐ受講人数規模。
- NGS速習コース講習会(平成26年度)
- NGSハンズオン講習会(平成27年度)
- 東大農で2015年07月22日〜08月06日(A日程)および08月26-28日(B日程)に実施
- 座学部分は全て自習にしてハンズオンに特化。講師数4人
- 講習会映像は統合TVと
Youtubeから公開
- 報告書
- NGSハンズオン講習会(平成28年度)
- 東大農で2016年07月19日〜08月04日に実施
- 中〜上級レベルの内容を新規提供。講師数6人
- 講習会映像は統合TVと
Youtubeから公開
- 報告書(もうすぐ公開2017.04.10現在)
- NGSハンズオン講習会(平成29年度)
自習用教材
- (Rで)塩基配列解析
- NGS系のそれっぽいキーワードで検索すると大抵上位に出現。RのインストールからLinux環境でのNGS解析まで幅広く解説。
- 日本乳酸菌学会誌上で2014年から連載中のNGS記事もこちらで提供。
- 統合TV
- 有用なデータベースやウェブツールの活用法を動画で紹介してくれます。
- Biopapyrus
- ここもNGS系のそれっぽいキーワードで検索すると大抵上位に出現。
Linux、Perlなどの各種インストール系や用語説明などが豊富。