受講について(本学の学生の方)

2021年度開講科目

今年度は以下の科目を開講します。全科目1単位で、農学生命科学研究科の共通科目として開講します。

科目番号 科目名
担当教員
3912135
 
生物配列解析基礎
清水謙多郎、大島研郎
3912136 ゲノム情報解析基礎
門田幸二、児玉悠一、森 宙史
3912103 バイオスタティスティクス基礎論
岩田洋佳
3912139 構造バイオインフォマティクス基礎
寺田 透、永田宏次、清水謙多郎
3912137 知識情報処理論
麻生川 稔
3912105 生物配列統計学
今年度は開講しません
3912106 分子モデリングと分子シミュレーション
寺田 透
3912138 オーム情報解析
今年度は開講しません
3912108 機能ゲノム学
門田幸二、谷澤靖洋
3912109 システム生物学概論
有田正規
3912157 フィールドインフォマティクス
大森良弘、井澤 毅、岩田洋佳、郭 威、反田直之
3912111 農学生命情報科学特論I
孫建強
3912112 農学生命情報科学特論II
今年度は開講しません
3912140 農学生命情報科学特論III
越塚登、小林真輔、大森良弘
3912141 農学生命情報科学特論IV
野尻秀昭、鈴木治夫、矢原耕史、新谷政己、野田尚宏
3912142 農学生命情報科学特別演習
本プログラム教員

担当教員は、多少変更となる場合があります。

受講申込方法

UTASで履修登録を行ってください。

単位の取得について

アグリバイオインフォマティクス教育研究プログラムの科目は、農学生命科学研究科の共通科目として開講します。 東京大学大学院の多くの専攻で、本プログラムで受講した科目の一部を(UTASでの登録を行うことによって)修士課程修了に必要な単位に加えることができます。 今年度の東京大学大学院農学生命科学研究科の各専攻における加えることのできる最大の単位数は以下の通りです。 いずれも指導教員の承認や専攻主任の認定が必要などとと書かれていますので、詳細は今年度の研究科便覧をご覧ください。

専攻名 加えることのできる単位数
生産・環境生物学専攻 4
応用生命化学専攻 4
応用生命工学専攻 4
森林科学専攻 4
水圏生物科学専攻 4
農業・資源経済学専攻 4
生物・環境工学専攻 6
生物材料科学専攻 研究科便覧を参照
農学国際専攻 6
生圏システム学専攻 6
応用動物科学専攻 4

修了認定要件

8科目以上合格された方へは、アグリバイオインフォマティクスの専門教育コースを修了したことを認定し、修了認定証を授与します。

農学生命情報科学特別演習の受講を希望される方は、登録前に本プログラム事務局までご連絡ください。

出席回数が講義回数の半分に満たない場合は、成績評価の対象となりません。

Q & A集

Q1:過去に5単位を取得しました。今年度開講科目のうち3単位を取得することで、アグリバイオインフォマティクスの専門教育コースを修得したことを認定してもらえますか?(「修了認定証」をもらえますか?)
A1:はい。認定します。

Q2:受講生募集要項には「出席回数が講義回数の半分に満たない場合は、成績評価の対象となりません」と書いてありますが、出席回数が半分に満たないとはどういう意味でしょうか?
A2:例えば全部で4回の講義の場合は2回以上出席しないと”未受験”となります。全部で7回の講義の場合は4回以上の出席が最低限必要ということになります。

Q3:ゼミや実験、実習などと講義が重なって受講できない・大幅に遅刻が見込まれる場合はどうしたらいいですか?オンデマンド配信を視聴できますか?
A3:予め講義を欠席する際は宛てにメールをいただければ、担当教員に転送します。教員によっては、課題の提出やオンデマンド配信を視聴することが可能です。

Q3-2:オンデマンド配信を視聴し、課題を提出すれば単位を取得できますか?
A3-2:担当教員の判断によります。宛てにメールをいただければ、担当教員に転送します。

Q4:インストールはうまくいっているようですがRStudio起動時にエラーが出てしまいます。
A4:(たとえ使用中のアカウントに管理者権限があっても)「管理者として実行」してみると、起動はできるという報告があります。

Q5:Zoomで聴講中に通信状況が悪くなったような挙動のあとに「ミーティングに問題があります。 金融情報などが流出する恐れがあります。接続を継続しますか?」のようなポップアップが出ました。どうすればよいでしょうか?
A5:報告例はまだ一例のみですが、この方は「接続しない」のボタンを押して一旦切り、再接続したらその後は普通に聴講することができたそうです。

Q6::UTASに登録を行いましたが、ITC-LMSに反映されておらず、出席登録をすることができません。どうしたら良いでしょうか?
A6:学生がUTASに登録後、ITC-LMSに反映されるまで1日程度かかります。ITC-LMSに未反映の状態で受講を希望される場合、出席については科目名および学籍番号、学部・学科・氏名をまでお知らせください。

Q7:履修登録の際、重複しているわけではないのですが、他の授業との都合で登録することができません。どうしたら良いでしょうか?
A7:UTASで履修登録をする際に、講義日程が重複していないにも関わらずエラーが出る場合は、どちらか一報をUTASで履修登録し、所属する研究科の教務課に追加登録申請書を提出してください。(参考:受講生募集要項 p.4 「5.受講上の注意」の【東京大学の学生の方】の5項目目)

Q8: 講義のZoom URLをクリックしていますが、毎回待機室に誘導されてしまいます。どうしたら良いでしょうか?
A8: ZoomにUTokyo Account(10桁の共通ID)でサインインしてないため、待機室に誘導されています。(UTASにログインすればZoomにもサインインするわけではありません。また、ECCSクラウドメール(@g.ecc.u-tokyo.ac.jp)ではありません。) 確認方法
いったん待機室を退出し、講義のZoom URLにアクセスする前に、WEBブラウザまたはアプリのどちらかの方法でZoomにサインインした後、講義のZoom URLにアクセスしてください。
Zoom サインイン方法 (English)
パスワードの入力を一定回数以上間違えると、30分間はサインインできなくなります。この場合は、待機室入室後、名前の表示を「学籍番号+名前」に変更し、スタッフに入室を許可してもらってください。また、なるべく休憩時間などにサインインし直して下さい。
なお、今後は待機室からの入室を許可しない場合もあり得ます。

Q9:「連携科目」とは何ですか?
A7:東京大学大学院生は、特定の授業科目を履修し合格すると、連携科目として本プログラムの修了に必要な単位に参入できます。(参考:受講生募集要項 p.3 「4.講義科目一覧」)

講義で使用予定のソフトウェア

2021年3月11日現在、以下に示すソフトウェアを使用予定です。 このうち、「Adobe Reader」と 「RStudioRも含む)」は多くの科目で利用するため、 無条件でのインストールを強く推奨します。「RとRStudio」のインストール方法については、 Windows2019.10.09版またはMacintosh2021.04.01版の手順通りに行ってください。 (そうでなければ必要なパッケージがインストールされませんのでご注意ください)

その他インストールに関して、不明な点がありましたら本プログラム事務局までお問い合わせください。

フリーソフト:

  • Zoom (全ての科目で使用)
  • Adobe Reader (多くの科目で使用予定)
  • Java (多くの科目で使用予定)
  • Lhaplus (いくつかの科目で使用予定)
  • R (多くの科目で使用予定)
  • RStudio (多くの科目で使用予定)
  • Anaconda (農学生命情報科学特論I)
  • ActivePerl (生物配列解析基礎と分子モデリング)
  • BLAST (生物配列解析基礎)
  • MEGA (生物配列解析基礎)
  • Python (生物配列解析基礎)
  • UCSF Chimera (構造バイオインフォマティクス基礎と分子モデリング)
  • Modeller (構造バイオインフォマティクス基礎)
  • CCP4 Software Suite (構造バイオインフォマティクス基礎)
  • AutoDock Vina (分子モデリング)
  • NAMD (分子モデリング)
  • CellDesigner (システム生物学概論)
  • Google Colaboratory (フィールドインフォマティクス・農学生命情報科学特論III)
  • VirtualBox (農学生命情報科学特論IV)

成績証明書の発行について

成績証明書の発行を希望される方は「こちら(Word)」または「こちら(PDF)」の申込用紙に必要事項を記入し、本プログラム事務局までメールでお送りください。