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各講義の詳細

     
カテゴリー 科目名 実施ターム
・単位
実施
曜日
基礎 生物配列解析基礎
生命科学のためのデータベースの利用と基本的な解析手法について講義します。配列データベースや機能データベースの使用法を紹介するとともに、ホモロジー検索、モチーフ解析、Perlプログラミング、系統解析などの基本的な手法について、実習形式で解説します。 S1・1 水曜
ゲノム情報解析基礎
フリーソフトRを用いた配列決定後の基礎情報取得など、各種配列解析の基本スキル向上を目指した実習を含む講義を行います。 S1・1 月曜
バイオスタティスティクス基礎論
統計解析ソフトウエアRを用いてバイオスタティスティクス基礎(生物統計学基礎)を学びます。初めてRを使用する受講生を対象に考え、ノートパソコンを使用した実習中心の講義を行います。 S1・1 金曜
構造バイオインフォマティクス基礎
タンパク質立体構造データベースの利用とその応用について解説します。また、立体構造決定における情報処理手法について解説します。 S1・1 木曜
方法論 知識情報処理論
パターン認識と機械学習の手法の紹介を行います。最終的にこれらの手法の基本的な概念を会得していただき、「各自が直面するであろう研究的な課題」に適用し、計算機を用いて実験データから発見ができることを目標とします。 SP-A1・1 金曜
生物配列統計学
ゲノムを比較して進化と環境への適応、集団の構造を理解する方法についてご紹介します。また、統計モデルを通して、表現型と生物配列の情報を統合して分析するアプローチを学びます。 S1-SP・1 水曜
分子モデリングと分子シミュレーション
分子軌道法、分子力学法、分子動力学法、モンテカルロ法、およびこれらの応用である複合体モデリングについて解説し、実習を行います。 S1-SP・1 木曜
オーム情報解析
-- 開講せず
機能ゲノム学
細胞中で発現している全転写物(トランスクリプトーム)解析手法について、特に塩基配列解析部分を中心に解説します。また、Rのスキルアップを目指します。 S1-SP・1 月曜
システム生物学概論
「生命をシステムとして理解する」ために必要な、オミックス研究データの統計的、グラフ論的手法について解説します。 SP・1 集中
フィールドインフォマティクス
オミクス情報を最大限に活用した育種、および生産の効率化・最適化を実現するために必要となるフィールドインフォマティクスの理論と技術を実習形式で解説します。 S1・1 火曜
先端
トピックス
農学生命情報科学特論I
NGSを用いた発現解析(RNA-seqカウントデータ解析)に関する内容を中心に、プログラムの使い分けや結果の解釈などの講義を行います。 SP・1 月曜
農学生命情報科学特論II
-- 開講せず
農学生命情報科学特論III
-- 開講せず
農学生命情報科学特論IV
微生物研究にどの様にインフォマティクスが利用され、興味深い知見が得られているのかを学びます。 SP・1 水曜
農学生命情報科学特別演習
アグリバイオインフォマティクス教育研究プログラムの特任教員・兼任教員の指導のもとで行う特別演習です。 W1・1 不定

先端トピックス 農学生命情報科学特別演習 農学生命情報科学特論I 農学生命情報科学特論II 農学生命情報科学特論III 農学生命情報科学特論IV オーム情報解析 知識情報処理論 生物配列統計学 分子モデリングと分子シミュレーション 方法論 フィールドインフォマティクス 機能ゲノム学 システム生物学概論 バイオスタティスティクス基礎論 構造バイオインフォマティクス基礎 ゲノム情報解析基礎 生物配列解析基礎 基礎