授業の目標・概要

ゲノム情報解析の基礎的な事柄やメタゲノム解析について解説します。また、バイオインフォマティクス分野で頻用されるk-mer解析について解説します。

担当教員

門田幸二 （東大・農・アグリバイオ / 准教授）
森 宙史 （国立遺伝学研究所 / 准教授）

参考図書

坊農秀雅、Dr.Bonoのゲノム解読、MEDSi、2024
門田幸二、清水謙多郎、岸野洋久、寺田透　共編著、Web連携テキスト　バイオ インフォマティクス　基礎から応用、培風館、2022

受講上の注意

東京大学の学生の方は、オンライン授業を受けるための準備を必ずしてください。

この講義はZoomを用いて実施します。（オンデマンド受講可能）

RStudioを利用予定です。
アグリバイオの教科書の付録ページの「R1.010 R本体とRStudioとパッケージのインストール」および「R1.020 RStudioの基本的な利用法」などを参考にして、R（もしくはRStudio）の基礎的な事柄を予習しておくことをお勧めします。

講義日程（2025年度）

  1. 2025年4月8日
    2. 講師：門田 幸二
  2. 2025年4月15日
    3. 講師：森 宙史
  3. 2025年4月22日
    4. 講師：森 宙史
  4. 2025年5月13日
    5. 講師：門田 幸二

講義日程（2024年度）

  1. 2024年4月9日
    2. 講師：門田 幸二
  2. 2024年4月16日
    3. 講師：森 宙史
  3. 2024年4月23日
    4. 講師：森 宙史
  4. 2024年4月30日
    5. 講師：門田 幸二

講義日程（2023年度）

  1. 2023年4月11日
    2. 講師：門田 幸二
  2. 2023年4月18日
    3. 講師：児玉 悠一
  3. 2023年4月25日
    4. 講師：森 宙史
  4. 2023年5月2日
    5. 講師：森 宙史

講義日程（2022年度）

  1. 2022年4月5日
    2. 講師：門田 幸二
  2. 2022年4月12日
    3. 講師：児玉 悠一
  3. 2022年4月19日
    4. 講師：森 宙史
  4. 2022年4月26日
    5. 講師：森 宙史

講義日程（2021年度）

  1. 2021年4月6日
    2. 講師：門田 幸二
  2. 2021年4月13日
    3. 講師：児玉 悠一
  3. 2021年4月20日
    4. 講師：森 宙史
  4. 2021年4月27日
    5. 講師：森 宙史

講義日程（2020年度）

  1. 2020年4月13日
    2. 講師：門田 幸二
  2. 2020年4月14日
    3. 講師：児玉 悠一
  3. 2020年4月21日
    4. 講師：森 宙史
  4. 2020年4月28日
    5. 講師：森 宙史

講義日程（2019年度）

  1. 2019年4月8日
  2. 2019年4月15日
  3. 2019年4月22日
  4. 2019年5月13日

講義日程（平成30年度）

  1. 平成30年4月16日
    2. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  2. 平成30年4月23日
    3. 講師：門田幸二
  3. 平成30年5月7日
    4. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  4. 平成30年5月14日
    5. 講師：勝間 進

講義日程（平成29年度）

  1. 平成29年4月17日
    2. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  2. 平成29年4月18日
    3. 講師：門田幸二
  3. 平成29年4月24日
    4. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  4. 平成29年5月1日
    5. 講師：勝間 進

講義日程（平成28年度）

  1. 平成28年4月11日
    2. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  2. 平成28年4月18日
    3. 講師：門田幸二
  3. 平成28年4月25日
    4. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  4. 平成28年5月2日
    5. 講師：勝間 進

講義日程（平成27年度）

  1. 平成27年4月7日
    2. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  2. 平成27年4月14日
    3. 講師：門田幸二
  3. 平成27年4月21日
    4. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  4. 平成27年4月28日
    5. 講師：勝間 進

講義日程（平成26年度）

  1. 平成26年4月9日
    2. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  2. 平成26年4月23日
    3. 講師：門田幸二
  3. 平成26年4月30日
    4. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  4. 平成26年5月7日
    5. 講師：嶋田 透

講義日程（平成25年度）

  1. 平成25年4月8日
    2. 講師：門田幸二(17:15-18:45)
    講師：中井雄治(19:00-20:30)
  2. 平成25年4月15日
    3. 講師：門田幸二(17:15-20:30)
  3. 平成25年4月19日
    4. 講師：嶋田 透
  4. 平成25年4月26日
    5. 講師：嶋田 透

講義日程（平成24年度）

  1. 平成24年4月16日
    2. 講師：嶋田 透(17:15-18:45)
    講師：門田幸二(19:00-20:30)
  2. 平成24年4月23日
    3. 講師：門田幸二
  3. 平成24年5月7日
    4. 講師：嶋田 透
    講師：中井雄治
  4. 平成24年5月14日
    5. 講師：嶋田 透

講義日程（平成23年度）

  1. 平成23年4月21日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成23年4月28日
    3. 講師：嶋田 透
    講師：門田幸二
  3. 平成23年5月12日
    4. 講師：嶋田 透
    講師：中井雄治
  4. 平成23年5月19日
    5. 講師：嶋田 透

講義日程（平成22年度）

  1. 平成22年4月15日
  2. 平成22年5月10日
  3. 平成22年5月24日
  4. 平成22年6月7日