授業の目標・概要

「生命をシステムとして理解する」ために必要な、オミックス研究データの統計的、グラフ論的手法について解説します。集中講義形式でビッグデータ、オミックス解析、ネットワーク解析といわれる分野の根底にある考え方(次元圧縮やスパースモデリング)を紹介します。また近年の研究動向も紹介します。

担当教員

有田正規 (国立遺伝学研究所 / 教授)

お知らせ

この講義は集中講義です。講義時間は他の講義と異なり、13:00-17:00です。

東京大学の学生の方は、オンライン授業を受けるための準備を必ずしてください。

この講義はZoomを用いて実施します。ソフトウェアのインストールページを参照し、各自のPCに必要なソフトウェアを予めインストールしてください。

本講義では、以下のフリーソフトを使用します。あらかじめインストールしておいてください。

参考図書

講義日程(2022年度)

  1. 2022年7月1日
  2. 2022年7月15日
  3. 2022年7月22日

講義日程(2021年度)

  1. 2021年6月11日
  2. 2021年6月18日
  3. 2021年6月25日

講義日程(2020年度)

  1. 2020年6月12日
  2. 2020年6月19日
  3. 2020年6月26日

講義日程(2019年度)

  1. 2019年6月7日(PC使用)化学第3講義室
  2. 2019年6月14日(PC使用)化学第3講義室
  3. 2019年6月21日(PC使用)化学第3講義室

講義日程(平成30年度)

  1. 平成30年6月4日(PC使用)化学第3講義室
  2. 平成30年6月11日(PC使用)化学第3講義室
  3. 平成30年6月18日(PC使用)午後:化学第3講義室

講義日程(平成29年度)

  1. 平成29年6月5日(PC使用)化学第3講義室
  2. 平成29年6月6日(PC使用)午前中:化学第1講義室 午後:化学第3講義室
  3. 平成29年6月7日(PC使用)午前中:化学第1講義室 午後:化学第3講義室

講義日程(平成27年度)

授業資料へのリンク
  1. 平成27年7月16日(PC使用)
  2. 平成27年7月17日(PC使用)

講義日程(平成25年度)

  1. 平成25年5月23日(PC使用)
  2. 平成25年5月30日(PC使用)
  3. 平成25年6月4日(PC使用)
  4. 平成25年6月13日(PC使用)

講義日程(平成24年度)

  1. 平成24年5月29日(PC使用)
  2. 平成24年5月31日(PC使用)
  3. 平成24年6月5日(PC使用)
  4. 平成24年6月7日(PC使用)

講義日程(平成23年度)

授業資料のトップページへのリンク
  1. 平成23年5月26日(PC使用)
  2. スケールフリーネットワーク
    リンク解析、ページランク
    ネットワーク用ソフトウェア
    Cytoscape
  3. 平成23年6月2日(PC使用)
  4. 代謝物の抽出
    代謝物の測定
    代謝データベース
  5. 平成23年6月9日(PC使用)
  6. タンパク質の測定
    タンパク質データベース
  7. 平成23年6月16日(PC使用)
  8. Modularity
    CellDesigner

講義日程(平成22年度)

  1. 平成22年5月12日(PC不使用)
  2. 平成22年5月20日(PC不使用)
  3. 平成22年6月9日(PC不使用)
  4. 平成22年6月17日(PC使用)