10.システム生物学概論
授業の目標・概要
「生命をシステムとして理解する」ために必要な、オミックス情報解析の統計的、グラフ論的手法について解説します。
集中講義形式でビッグデータ、オミックス解析、ネットワーク解析といわれる分野の根底にある考え方（次元圧縮やスパースモデリング）を紹介します。また、近年の研究動向も紹介します。集中講義形式のため3日間で7コマ分の授業を行います。
担当教員
有田正規 （国立遺伝学研究所 / 教授）
受講上の注意
この講義は集中講義です。講義時間は他の講義と異なり、13:00-17:00です。但し、7/11は13:15開始です。
東京大学の学生の方は、オンライン授業を受けるための準備を必ずしてください。
この講義はZoomを用いて実施します。（オンデマンド受講可能）
本講義では、以下のフリーソフトを使用します。あらかじめインストールしておいてください。ColabについてはGoogleアカウントを取得しておいてください.
- Google Colaboratory (Colab)
- CellDesigner
- Rを利用予定です。アグリバイオの教科書の付録ページの「R1.010 R本体とRStudioとパッケージのインストール」および「R1.020 RStudioの基本的な利用法」を参考にして、基礎的な事柄を理解しておいてください。
参考図書
-
門田幸二、清水謙多郎、岸野洋久、寺田透 共編著、Web連携テキスト バイオ
インフォマティクス 基礎から応用
、培風館、2022
講義日程（2025年度）
- 2024年7月4日
- 2024年7月11日13:15開始
- 2024年7月18日
講義日程（2024年度）
- 2024年7月5日
- 2024年7月12日13:15開始
- 2024年7月19日
講義日程（2023年度）
- 2023年7月7日
- 2023年7月14日13:10開始
- 2023年7月21日
講義日程（2022年度）
- 2022年7月1日
- 2022年7月15日
- 2022年7月22日
講義日程（2021年度）
- 2021年6月11日
- 2021年6月18日
- 2021年6月25日
講義日程（2020年度）
- 2020年6月12日
- 2020年6月19日
- 2020年6月26日
講義日程（2019年度）
- 2019年6月7日 化学第３講義室
- 2019年6月14日 化学第３講義室
- 2019年6月21日 化学第３講義室
講義日程（平成30年度）
- 平成30年6月4日 化学第３講義室
- 平成30年6月11日 化学第３講義室
- 平成30年6月18日 午後：化学第３講義室
講義日程（平成29年度）
- 平成29年6月5日 化学第３講義室
- 平成29年6月6日 午前中：化学第１講義室 午後：化学第３講義室
- 平成29年6月7日 午前中：化学第１講義室 午後：化学第３講義室
講義日程（平成27年度）
- 平成27年7月16日
- 平成27年7月17日
講義日程（平成25年度）
- 平成25年5月23日
- 平成25年5月30日
- 平成25年6月4日
- 平成25年6月13日
講義日程（平成24年度）
- 平成24年5月29日
- 平成24年5月31日
- 平成24年6月5日
- 平成24年6月7日
講義日程（平成23年度）
- 平成23年5月26日
- 平成23年6月2日
- 平成23年6月9日
- 平成23年6月16日
講義日程（平成22年度）
- 平成22年5月12日（PC不使用）
- 平成22年5月20日（PC不使用）
- 平成22年6月9日（PC不使用）
- 平成22年6月17日