授業の目標・概要

生命科学のためのデータベースの利用と基本的な解析手法について講義します。
配列データベースや機能データベースの使用法を紹介するとともに、ホモロジー検索、モチーフ解析、Pythonプログラミング、系統解析などの基本的な手法について、実習形式で解説します。
塩基配列、アミノ酸配列の解析方法や各種データベースについて基礎から学びたい人は、ぜひ本講義を受講して下さい。

担当教員

清水謙多郎 （東大・農 / 特任教授）
大島研郎 （法政大学生命科学部 / 教授）
門田幸二 （東大・農 / 准教授）

参考図書

坊農秀雅、Dr.Bonoのゲノム解読、MEDSi、2024
監修：坊農秀雅、小野浩雅、生命科学研究のためのデジタルツール入門 第2版、MEDSi、2024
門田幸二、清水謙多郎、岸野洋久、寺田透　共編著、Web連携テキスト　バイオ インフォマティクス　基礎から応用 、培風館、2022

受講上の注意

東京大学の学生の方は、オンライン授業を受けるための準備を必ずしてください。

この講義はZoomを用いて実施します。（オンデマンド受講可能）

この講義はZoom、BLAST、MEGA、Pythonを用いて実施します。ソフトウェアのインストールページを参照し、各自のPCに必要なソフトウェアを予めインストールしてください。

講義日程（2025年度）

  1. 2025年4月9日
    2. 講師：大島研郎
  2. 2025年4月16日
    3. 講師：大島研郎
  3. 2025年4月23日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 2025年4月30日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（2024年度）

  1. 2024年4月10日
    2. 講師：大島研郎
  2. 2024年4月17日
    3. 講師：大島研郎
  3. 2024年4月24日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 2024年5月1日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（2023年度）

  1. 2023年4月19日
    2. 講師：大島研郎
  2. 2023年4月26日
    3. 講師：大島研郎
  3. 2023年5月10日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 2023年5月17日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（2022年度）

  1. 2022年4月6日
    2. 講師：大島研郎
  2. 2022年4月13日
    3. 講師：大島研郎
  3. 2022年4月20日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 2022年4月27日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（2021年度）

  1. 2021年4月7日
    2. 講師：大島研郎
  2. 2021年4月14日
    3. 講師：大島研郎
  3. 2021年4月21日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 2021年4月28日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（2020年度）

  1. 2020年4月8日
    2. 講師：大島研郎
  2. 2020年4月15日
    3. 講師：大島研郎
  3. 2020年4月20日
    4. 講師：大島研郎
  4. 2020年4月22日
    5. 講師：清水謙多郎
  5. 2020年5月11日
    6. 講師：大島研郎

講義日程（2019年度）

  1. 2019年4月10日
    2. 講師：大島研郎
  2. 2019年4月17日
    3. 講師：大島研郎
  3. 2019年4月24日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 2019年5月8日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（平成30年度）

  1. 平成30年4月11日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成30年4月18日
    3. 講師：大島研郎
  3. 平成30年4月25日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 平成30年5月2日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（平成29年度）

  1. 平成29年4月19日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成29年4月26日
    3. 講師：清水謙多郎
  3. 平成29年5月10日
    4. 講師：大島研郎
  4. 平成29年5月17日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（平成28年度）

  1. 平成28年4月13日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成28年4月20日
    3. 講師：大島研郎
  3. 平成28年4月27日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 平成28年5月11日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（平成27年度）

  1. 平成27年4月8日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成27年4月15日
    3. 講師：大島研郎
  3. 平成27年4月22日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 平成27年5月13日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（平成26年度）

  1. 平成26年4月8日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成26年4月15日
    3. 講師：大島研郎
  3. 平成26年4月22日
    4. 講師：大島研郎
  4. 平成26年4月25日
    5. 講師：清水謙多郎

講義日程（平成25年度）

  1. 平成25年4月9日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成25年4月23日
    3. 講師：大島研郎
  3. 平成24年5月7日
    4. 講師：清水謙多郎
  4. 平成24年5月14日
    5. 講師：大島研郎

講義日程（平成24年度）

  1. 平成24年4月10日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成24年4月24日
    3. 講師：大島研郎
  3. 平成24年5月8日
    4. 講師：西田洋巳
  4. 平成24年5月15日
    5. 講師：清水謙多郎

講義日程（平成23年度）

  1. 平成23年4月18日
    2. 講師：大島研郎
  2. 平成23年4月25日
    3. 講師：清水謙多郎
  3. 平成23年5月9日
  4. 平成23年5月16日

講義日程（平成22年度）

  1. 平成22年4月21日
  2. 平成22年5月11日
  3. 平成22年5月25日
  4. 平成22年6月8日