授業の目標・概要

生命科学のためのデータベースの利用と基本的な解析手法について講義します。 配列データベースや機能データベースの使用法を紹介するとともに、ホモロジー検索、モチーフ解析、プログラミング、系統解析などの基本的な手法について、実習形式で解説します。
バイオインフォマティクス関連の各種データベースにアクセスしたことのない人は、ぜひ本講義を受講して下さい。

担当教員

清水謙多郎 (東大・農・応用生命工学専攻 / 教授)
大島研郎 (法政大学生命科学部 / 教授)

参考図書

藤博幸・編、よくわかるバイオインフォマティクス入門、講談社、2018
坊農秀雅、Dr.Bonoの生命科学データ解析、MEDSi、2021

お知らせ

東京大学の学生の方は、オンライン授業を受けるための準備を必ずしてください。

この講義はZoomを用いて実施します。ソフトウェアのインストールページを参照し、各自のPCに必要なソフトウェアを予めインストールしてください。

講義日程(2021年度)

  1. 2021年4月7日
  2. 講師:大島研郎
  3. 2021年4月14日
  4. 講師:大島研郎
  5. 2021年4月21日
  6. 講師:清水謙多郎
  7. 2021年4月28日
  8. 講師:大島研郎

講義日程(2020年度)

  1. 2020年4月8日17:15~18:00
  2. 講師:大島研郎
    Zoom接続練習およびガイダンス

  3. 2020年4月15日
  4. 講師:大島研郎
  5. 2020年4月20日
  6. 講師:大島研郎
  7. 2020年4月22日
  8. 講師:清水謙多郎

  9. 2020年5月11日
  10. 講師:大島研郎

講義日程(2019年度)

  1. 2019年4月10日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 2019年4月17日(PC使用)
  4. 講師:大島研郎
  5. 2019年4月24日(PC使用)
  6. 講師:清水謙多郎
    バイオインフォマティクス実習

  7. 2019年5月8日(PC使用)
  8. 講師:大島研郎

講義日程(平成30年度)

  1. 平成30年4月11日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成30年4月18日(PC使用)
  4. 講師:大島研郎
  5. 平成30年4月25日(PC使用)
  6. 講師:清水謙多郎
    タンパク質の配列から機能を予測する

  7. 平成30年5月2日(PC使用)
  8. 講師:大島研郎

講義日程(平成29年度)

  1. 平成29年4月19日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成29年4月26日(PC使用)
  4. 講師:清水謙多郎
    タンパク質の配列から機能を予測する

  5. 平成29年5月10日(PC使用)
  6. 講師:大島研郎
  7. 平成29年5月17日(PC使用)
  8. 講師:大島研郎

講義日程(平成28年度)

  1. 平成28年4月13日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成28年4月20日(PC使用)
  4. 講師:大島研郎
  5. 平成28年4月27日(PC使用)
  6. 講師:清水謙多郎
    タンパク質の配列から機能を予測する

  7. 平成28年5月11日(PC使用)
  8. 講師:大島研郎

講義日程(平成27年度)

  1. 平成27年4月8日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成27年4月15日(PC使用)
  4. 講師:大島研郎
  5. 平成27年4月22日(PC使用)
  6. 講師:清水謙多郎
    アミノ酸配列から機能を探る

  7. 平成27年5月13日(PC使用)
  8. 講師:大島研郎

講義日程(平成26年度)

  1. 平成26年4月8日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成26年4月15日(PC使用)
  4. 講師:大島研郎
  5. 平成26年4月22日(PC使用)
  6. 講師:大島研郎
  7. 平成26年4月25日(PC使用)日程が5/9より変更になりました!
  8. 講師:清水謙多郎
    配列のマルチプルアラインメントとその利用

講義日程(平成25年度)

  1. 平成25年4月9日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成25年4月23日(PC使用)
  4. 講師:大島研郎
  5. 平成24年5月7日(PC使用)
  6. 講師:清水謙多郎
    配列から機能を探る

  7. 平成24年5月14日(PC使用)
  8. 講師:大島研郎

講義日程(平成24年度)

  1. 平成24年4月10日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成24年4月24日(PC使用)
  4. 講師:大島研郎
  5. 平成24年5月8日(PC使用)
  6. 講師:西田洋巳
    分子系統学基礎
    確認テスト正解

  7. 平成24年5月15日(PC使用)
  8. 講師:清水謙多郎

講義日程(平成23年度)

  1. 平成23年4月18日(PC使用)
  2. 講師:大島研郎
  3. 平成23年4月25日(PC使用)
  4. 講師:清水謙多郎
    講義資料はこちら
  5. 平成23年5月9日(PC使用)
  6. 平成23年5月16日(PC使用)
  7. link.htm
    mrbayes.exe
    dnapars.exe
    16s21t_phylip.txt
    16s16t_mb.nex

講義日程(平成22年度)

  1. 平成22年4月21日(PC使用)
  2. 平成22年5月11日(PC使用)
  3. motif.html
  4. 平成22年5月25日(PC使用)
  5. motif.html
  6. 平成22年6月8日(PC使用)